没什么区别。
定期存单的黑色公章和红色公章的区别就是一个是交易打印的电子印章，一个是手工加盖的业务印章。二者的作用是一样的，具有相同效力。
银行定期存单的黑色章属于机打凭证类的单子，显示黑色印章的一般是回执类、对账类、查询类等等的单子，比如说在自助取款机上取款或者存款打印的凭证，只是为了客户知晓而存在的。红色印章是机出单子后银行工作人员手工加盖上的，一般涉及的是凭证类的单子，比如存单、存折等等，需要客户走账的单子就会加盖红章。现在银行票单上大多都是使用的黑色电子章，除了一些特殊的专用章之外，客户一般可以在官网或者利用印章上的验证码查询此章的真假。
纸质定期存单安全吗
在银行办理的纸质定期存单是安全的。随着时代的发展纸质定期存单正慢慢被电子账单所取代，因为纸质定期存单容易丢失不易保存，再加上印刷的成本费用增加，所以很多银行都慢慢不再主动提供纸质定期存单了，但为了给予老年顾客方便，银行还是会以纸质存单的方式记载相关业务办理的情况。用户要好好保存纸质定期存单，因为上面记载了用户的个人信息，丢失的话不利于个人隐私的安全。
定期存单银行在盖章的时候有可能是模糊不清的,但是这并不影响存单的真实效力如果不放心,可以拿定期存单到银行柜面办理查询,或者是要求银行重新加盖公章。
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