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上游引物是什么?f引物和r引物的区别是什么?

时间 2023-04-21 14:08:41 来源:京华在线网  

上游引物是DNA分子两端不一样,因为核苷酸分子不是对称的,5'位有个磷酸,3'位是-OH,也就是:磷酸端和羟基端。DNA复制总是从5’端到3’端,因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。引物在聚合作用的起始时,可以刺激合成另一种大分子,并与反应物以共价键形式连接的序列。在核酸化学中,引物是一段短的单链RNA或DNA片段,可结合在核酸链上与之互补的区域,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点,核酸聚合酶可由其3′端开始合成新的核酸链。体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等。我们已经知道3‘——5’这条链为负链,其引物为正向引物(又称为有义链引物。同样,互补链5‘——3’为正链,5‘——3'这条链的引物就叫做反向引物(又称为反义链引物。

f引物和r引物的区别是什么?

F:Forward primer 上游引物R:Reverse primer 下游引物。正向引物,反向引物。引物自身及引物之间不应存在互补序列。连续互补的碱基应该要少于4 个。引物应使其G值不要太高,G值越大,则双链越稳定。

引物长度和GC 含量要适中。引物长度大概为18~28 bp,但不应大于38 bp,引物过短会影响到扩增的特异,太长的话其延伸温度将会大于74 ℃,不利Taq 酶的催化反应。若扩增产物为4~5 kb,引物最好不要少于24bp。

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